Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odc1P00860 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odc1P00860 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odc1P00860 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odc1P00860 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odc1P00860 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odc1P00860 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odc1P00860 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odc1P00860 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms