Protein–RNA interactions for Protein: P00397

Mtco1, Cytochrome c oxidase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco1P00397 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mtco1P00397 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mtco1P00397 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtco1P00397 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms