Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcn2O88968 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms