Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
BlmO88700 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BlmO88700 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BlmO88700 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
BlmO88700 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
BlmO88700 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BlmO88700 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
BlmO88700 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BlmO88700 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BlmO88700 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BlmO88700 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BlmO88700 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BlmO88700 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BlmO88700 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BlmO88700 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BlmO88700 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
BlmO88700 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BlmO88700 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BlmO88700 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
BlmO88700 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BlmO88700 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BlmO88700 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BlmO88700 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BlmO88700 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BlmO88700 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BlmO88700 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BlmO88700 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
BlmO88700 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BlmO88700 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BlmO88700 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
BlmO88700 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BlmO88700 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BlmO88700 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BlmO88700 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BlmO88700 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BlmO88700 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BlmO88700 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BlmO88700 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BlmO88700 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
BlmO88700 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BlmO88700 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
BlmO88700 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BlmO88700 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BlmO88700 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BlmO88700 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BlmO88700 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BlmO88700 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BlmO88700 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BlmO88700 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BlmO88700 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BlmO88700 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BlmO88700 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BlmO88700 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BlmO88700 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BlmO88700 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BlmO88700 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BlmO88700 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BlmO88700 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BlmO88700 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BlmO88700 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BlmO88700 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BlmO88700 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
BlmO88700 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BlmO88700 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BlmO88700 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BlmO88700 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BlmO88700 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
BlmO88700 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
BlmO88700 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
BlmO88700 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
BlmO88700 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BlmO88700 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BlmO88700 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BlmO88700 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BlmO88700 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BlmO88700 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BlmO88700 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BlmO88700 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
BlmO88700 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BlmO88700 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BlmO88700 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
BlmO88700 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BlmO88700 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BlmO88700 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BlmO88700 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BlmO88700 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BlmO88700 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BlmO88700 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BlmO88700 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BlmO88700 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BlmO88700 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BlmO88700 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BlmO88700 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BlmO88700 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BlmO88700 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BlmO88700 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BlmO88700 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BlmO88700 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BlmO88700 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BlmO88700 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms