Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnmt3aO88508 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms