Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc4a4O88343 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a4O88343 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a4O88343 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms