Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sorl1O88307 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sorl1O88307 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms