Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cfdp1O88271 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cfdp1O88271 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfdp1O88271 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms