Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cer1O55233 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cer1O55233 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cer1O55233 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cer1O55233 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cer1O55233 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cer1O55233 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cer1O55233 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cer1O55233 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cer1O55233 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cer1O55233 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cer1O55233 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cer1O55233 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cer1O55233 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cer1O55233 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cer1O55233 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cer1O55233 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cer1O55233 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms