Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChadO55226 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ChadO55226 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChadO55226 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChadO55226 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChadO55226 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChadO55226 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChadO55226 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChadO55226 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChadO55226 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChadO55226 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChadO55226 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChadO55226 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ChadO55226 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChadO55226 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ChadO55226 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ChadO55226 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChadO55226 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChadO55226 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChadO55226 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChadO55226 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ChadO55226 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChadO55226 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChadO55226 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChadO55226 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ChadO55226 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChadO55226 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChadO55226 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChadO55226 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChadO55226 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChadO55226 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ChadO55226 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChadO55226 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ChadO55226 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChadO55226 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChadO55226 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChadO55226 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChadO55226 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChadO55226 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChadO55226 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ChadO55226 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChadO55226 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ChadO55226 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ChadO55226 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChadO55226 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChadO55226 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChadO55226 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChadO55226 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ChadO55226 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ChadO55226 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChadO55226 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChadO55226 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChadO55226 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChadO55226 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChadO55226 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChadO55226 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ChadO55226 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChadO55226 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChadO55226 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ChadO55226 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ChadO55226 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChadO55226 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChadO55226 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChadO55226 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChadO55226 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChadO55226 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChadO55226 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChadO55226 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChadO55226 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChadO55226 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChadO55226 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChadO55226 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChadO55226 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChadO55226 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChadO55226 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChadO55226 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChadO55226 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChadO55226 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChadO55226 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChadO55226 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChadO55226 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChadO55226 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChadO55226 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChadO55226 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChadO55226 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChadO55226 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChadO55226 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChadO55226 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChadO55226 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChadO55226 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChadO55226 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChadO55226 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChadO55226 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChadO55226 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChadO55226 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChadO55226 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ChadO55226 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChadO55226 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms