Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
StrnO55106 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
StrnO55106 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
StrnO55106 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
StrnO55106 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StrnO55106 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
StrnO55106 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StrnO55106 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StrnO55106 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
StrnO55106 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StrnO55106 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
StrnO55106 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StrnO55106 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StrnO55106 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StrnO55106 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StrnO55106 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
StrnO55106 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StrnO55106 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StrnO55106 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StrnO55106 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StrnO55106 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StrnO55106 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StrnO55106 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
StrnO55106 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
StrnO55106 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
StrnO55106 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
StrnO55106 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
StrnO55106 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
StrnO55106 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
StrnO55106 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
StrnO55106 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
StrnO55106 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
StrnO55106 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
StrnO55106 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
StrnO55106 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
StrnO55106 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
StrnO55106 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
StrnO55106 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
StrnO55106 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
StrnO55106 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
StrnO55106 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
StrnO55106 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
StrnO55106 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
StrnO55106 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
StrnO55106 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
StrnO55106 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StrnO55106 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StrnO55106 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StrnO55106 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StrnO55106 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
StrnO55106 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StrnO55106 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StrnO55106 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StrnO55106 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StrnO55106 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
StrnO55106 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
StrnO55106 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
StrnO55106 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
StrnO55106 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
StrnO55106 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
StrnO55106 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StrnO55106 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StrnO55106 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StrnO55106 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StrnO55106 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
StrnO55106 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StrnO55106 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
StrnO55106 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
StrnO55106 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
StrnO55106 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
StrnO55106 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
StrnO55106 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
StrnO55106 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
StrnO55106 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
StrnO55106 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
StrnO55106 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
StrnO55106 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
StrnO55106 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
StrnO55106 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
StrnO55106 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
StrnO55106 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
StrnO55106 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
StrnO55106 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
StrnO55106 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
StrnO55106 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
StrnO55106 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
StrnO55106 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
StrnO55106 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
StrnO55106 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
StrnO55106 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
StrnO55106 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
StrnO55106 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
StrnO55106 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
StrnO55106 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
StrnO55106 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
StrnO55106 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
StrnO55106 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
StrnO55106 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
StrnO55106 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
StrnO55106 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms