Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb2O55029 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb2O55029 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb2O55029 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copb2O55029 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Copb2O55029 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Copb2O55029 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb2O55029 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb2O55029 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Copb2O55029 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Copb2O55029 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Copb2O55029 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Copb2O55029 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Copb2O55029 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copb2O55029 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Copb2O55029 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Copb2O55029 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms