Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Bnip3O55003 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bnip3O55003 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bnip3O55003 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms