Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn5O54942 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn5O54942 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn5O54942 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms