Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgals6O54891 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgals6O54891 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.7 ms