Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp1baO35930 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1baO35930 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1baO35930 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1baO35930 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms