Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nedd9O35177 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd9O35177 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms