Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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H2-Q1O19441 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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H2-Q1O19441 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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H2-Q1O19441 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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H2-Q1O19441 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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H2-Q1O19441 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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H2-Q1O19441 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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H2-Q1O19441 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Q1O19441 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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H2-Q1O19441 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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H2-Q1O19441 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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H2-Q1O19441 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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H2-Q1O19441 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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H2-Q1O19441 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Q1O19441 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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