Protein–RNA interactions for Protein: O08648

Map3k4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k4O08648 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Map3k4O08648 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k4O08648 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Map3k4O08648 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Map3k4O08648 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Map3k4O08648 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Map3k4O08648 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Map3k4O08648 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Map3k4O08648 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Map3k4O08648 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Map3k4O08648 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Map3k4O08648 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Map3k4O08648 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Map3k4O08648 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Map3k4O08648 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Map3k4O08648 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Map3k4O08648 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Map3k4O08648 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Map3k4O08648 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Map3k4O08648 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Map3k4O08648 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Map3k4O08648 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Map3k4O08648 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Map3k4O08648 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Map3k4O08648 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Map3k4O08648 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Map3k4O08648 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Map3k4O08648 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Map3k4O08648 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Map3k4O08648 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Map3k4O08648 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Map3k4O08648 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Map3k4O08648 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Map3k4O08648 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms