Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh11O08638 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh11O08638 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh11O08638 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myh11O08638 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myh11O08638 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myh11O08638 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myh11O08638 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Myh11O08638 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myh11O08638 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myh11O08638 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myh11O08638 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myh11O08638 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myh11O08638 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myh11O08638 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myh11O08638 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myh11O08638 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms