Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Efna3O08545 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Efna3O08545 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Efna3O08545 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Efna3O08545 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Efna3O08545 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Efna3O08545 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efna3O08545 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efna3O08545 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Efna3O08545 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Efna3O08545 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms