Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C5

Gm3264, Predicted gene 3264, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3264L7N2C5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3264L7N2C5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3264L7N2C5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3264L7N2C5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms