Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa3bJ9JI28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vwa3bJ9JI28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vwa3bJ9JI28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vwa3bJ9JI28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms