Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34c3J3QJW5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34c3J3QJW5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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