Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20815J3KMI0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20815J3KMI0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20815J3KMI0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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