Protein–RNA interactions for Protein: H3BJD6

Ppp1r9a, Protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 9A, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r9aH3BJD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r9aH3BJD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r9aH3BJD6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms