Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc4lG5E8X2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc4lG5E8X2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms