Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ercc6F8VPZ5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
Ercc6F8VPZ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Ercc6F8VPZ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ercc6F8VPZ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ercc6F8VPZ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181 ms