Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp9yF8VPU6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp9yF8VPU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp9yF8VPU6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms