Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zc3h7bF8VPP8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h7bF8VPP8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300.7 ms