Protein–RNA interactions for Protein: E9Q046

Tcp10c, T-complex protein 10c, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp10cE9Q046 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcp10cE9Q046 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcp10cE9Q046 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcp10cE9Q046 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcp10cE9Q046 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcp10cE9Q046 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcp10cE9Q046 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcp10cE9Q046 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcp10cE9Q046 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcp10cE9Q046 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms