Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4931408C20RikE9PWP9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4931408C20RikE9PWP9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
4931408C20RikE9PWP9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
4931408C20RikE9PWP9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4931408C20RikE9PWP9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
4931408C20RikE9PWP9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4931408C20RikE9PWP9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
4931408C20RikE9PWP9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms