Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Piezo1E2JF22 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Piezo1E2JF22 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Piezo1E2JF22 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms