Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb3D3Z6J4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms