Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc8D3YZV8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc8D3YZV8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms