Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Kif28pD3YXS5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kif28pD3YXS5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kif28pD3YXS5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms