Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc13D3YV10 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms