Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ptprz1B9EKR1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 293.5 ms