Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp26c1B2RXA7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp26c1B2RXA7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp26c1B2RXA7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms