Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprbB2RU80 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.46■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprbB2RU80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprbB2RU80 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms