Protein–RNA interactions for Protein: B2RR88

Zfp964, EG636741 protein, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp964B2RR88 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp964B2RR88 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp964B2RR88 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp964B2RR88 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms