Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ythdc2B2RR83 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ythdc2B2RR83 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ythdc2B2RR83 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ythdc2B2RR83 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ythdc2B2RR83 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms