Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r5B2RQT2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r5B2RQT2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r5B2RQT2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms