Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Trabd2bB1ATG9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trabd2bB1ATG9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trabd2bB1ATG9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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