Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhox1B1APN4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox1B1APN4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox1B1APN4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms