Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2c2A7L9Z8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2c2A7L9Z8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2c2A7L9Z8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms