Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prss40A6H6T1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prss40A6H6T1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prss40A6H6T1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms