Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6880A3KG45 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6880A3KG45 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms