Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl2A2ARM1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Patl2A2ARM1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Patl2A2ARM1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms