Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam205aA2APU8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam205aA2APU8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam205aA2APU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam205aA2APU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam205aA2APU8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam205aA2APU8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam205aA2APU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam205aA2APU8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam205aA2APU8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms